MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 7227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002679	CAG	3	9	171444	171452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488233
3502	NC_002679	AT	3	6	171488	171493	50 %	50 %	0 %	0 %	13488233
3503	NC_002679	CGC	2	6	171507	171512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488233
3504	NC_002679	CCA	2	6	171857	171862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488354
3505	NC_002679	CGG	2	6	172012	172017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_002679	CGG	2	6	172039	172044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_002679	GCT	2	6	172064	172069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_002679	GCAG	2	8	172203	172210	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_002679	CG	3	6	172303	172308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3510	NC_002679	TC	3	6	172315	172320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_002679	AGG	2	6	172392	172397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_002679	CGG	3	9	172624	172632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488234
3513	NC_002679	GGC	2	6	172648	172653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488234
3514	NC_002679	GTC	2	6	172688	172693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488234
3515	NC_002679	GCATGG	2	12	172734	172745	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13488234
3516	NC_002679	AAC	2	6	172754	172759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488234
3517	NC_002679	CGT	2	6	172762	172767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488234
3518	NC_002679	TCG	2	6	172827	172832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488234
3519	NC_002679	GCT	2	6	172863	172868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488234
3520	NC_002679	GAA	2	6	172939	172944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488234
3521	NC_002679	CCA	2	6	172948	172953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488234
3522	NC_002679	TGC	2	6	172968	172973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488234
3523	NC_002679	AAG	2	6	172997	173002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488234
3524	NC_002679	CTG	2	6	173103	173108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488234
3525	NC_002679	GCG	2	6	173171	173176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488234
3526	NC_002679	CGGCT	2	10	173329	173338	0 %	20 %	40 %	40 %	13488234
3527	NC_002679	ACT	2	6	173409	173414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488234
3528	NC_002679	GAT	2	6	173425	173430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488234
3529	NC_002679	ACC	2	6	173487	173492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488234
3530	NC_002679	CG	3	6	173550	173555	0 %	0 %	50 %	50 %	13488234
3531	NC_002679	GAT	2	6	173596	173601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488234
3532	NC_002679	TCG	2	6	173658	173663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488234
3533	NC_002679	CAC	2	6	173677	173682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488234
3534	NC_002679	CA	3	6	173724	173729	50 %	0 %	0 %	50 %	13488234
3535	NC_002679	GAGCGC	2	12	173837	173848	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13488234
3536	NC_002679	CAAC	2	8	173887	173894	50 %	0 %	0 %	50 %	13488234
3537	NC_002679	GGC	2	6	173910	173915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488234
3538	NC_002679	GCC	2	6	173935	173940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488234
3539	NC_002679	GAT	2	6	173993	173998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488234
3540	NC_002679	TCG	2	6	174012	174017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488234
3541	NC_002679	GTC	2	6	174055	174060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488234
3542	NC_002679	GGC	2	6	174082	174087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488234
3543	NC_002679	GAC	2	6	174161	174166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488234
3544	NC_002679	CTT	2	6	174185	174190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488234
3545	NC_002679	GAG	2	6	174260	174265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488234
3546	NC_002679	CGT	3	9	174351	174359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488355
3547	NC_002679	CGA	2	6	174468	174473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488355
3548	NC_002679	TGC	2	6	174681	174686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488235
3549	NC_002679	CTG	2	6	174692	174697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488235
3550	NC_002679	GGC	2	6	174772	174777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488235
3551	NC_002679	GGC	2	6	174796	174801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488235
3552	NC_002679	GCA	2	6	174827	174832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488235
3553	NC_002679	CTGAA	2	10	174846	174855	40 %	20 %	20 %	20 %	13488235
3554	NC_002679	GTCA	2	8	174890	174897	25 %	25 %	25 %	25 %	13488235
3555	NC_002679	GCGTT	2	10	174941	174950	0 %	40 %	40 %	20 %	13488235
3556	NC_002679	GGC	2	6	174976	174981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488235
3557	NC_002679	CG	3	6	175077	175082	0 %	0 %	50 %	50 %	13488235
3558	NC_002679	TCGG	2	8	175099	175106	0 %	25 %	50 %	25 %	13488235
3559	NC_002679	AGCC	2	8	175133	175140	25 %	0 %	25 %	50 %	13488235
3560	NC_002679	CGC	2	6	175141	175146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488235
3561	NC_002679	GCC	2	6	175151	175156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488235
3562	NC_002679	CGA	2	6	175171	175176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488235
3563	NC_002679	CGG	2	6	175200	175205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488235
3564	NC_002679	CCG	2	6	175254	175259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488235
3565	NC_002679	CGA	2	6	175267	175272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488235
3566	NC_002679	GTT	2	6	175351	175356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488235
3567	NC_002679	CGG	2	6	175392	175397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488235
3568	NC_002679	TCG	2	6	175421	175426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488235
3569	NC_002679	TC	3	6	175511	175516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_002679	AAG	2	6	175542	175547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_002679	GAC	2	6	175621	175626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_002679	GGGC	2	8	175702	175709	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_002679	TCGGC	2	10	175720	175729	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3574	NC_002679	CCCCA	2	10	175763	175772	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3575	NC_002679	GCA	2	6	175780	175785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_002679	AAG	2	6	175837	175842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488118
3577	NC_002679	ACC	2	6	175873	175878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488118
3578	NC_002679	GGC	2	6	175879	175884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488118
3579	NC_002679	CGG	2	6	175892	175897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488118
3580	NC_002679	CGA	2	6	175906	175911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488118
3581	NC_002679	GCG	2	6	176046	176051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488118
3582	NC_002679	GCG	3	9	176147	176155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488118
3583	NC_002679	CGA	2	6	176240	176245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488118
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3585	NC_002679	GC	3	6	176275	176280	0 %	0 %	50 %	50 %	13488118
3586	NC_002679	TCT	2	6	176333	176338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488118
3587	NC_002679	CTG	2	6	176352	176357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488118
3588	NC_002679	TGG	2	6	176377	176382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488118
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3590	NC_002679	AGG	2	6	176446	176451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488118
3591	NC_002679	GCT	2	6	176462	176467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488118
3592	NC_002679	GCG	2	6	176475	176480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488118
3593	NC_002679	GTC	2	6	176484	176489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488118
3594	NC_002679	CGCC	2	8	176567	176574	0 %	0 %	25 %	75 %	13488118
3595	NC_002679	CCG	2	6	176604	176609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488118
3596	NC_002679	ACC	2	6	176659	176664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488118
3597	NC_002679	T	6	6	176752	176757	0 %	100 %	0 %	0 %	13488118
3598	NC_002679	CTT	2	6	176763	176768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488118
3599	NC_002679	CGC	2	6	176784	176789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488118
3600	NC_002679	CGA	2	6	176810	176815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488118
3601	NC_002679	GCC	2	6	176835	176840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488118
3602	NC_002679	CTT	3	9	176862	176870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488118
3603	NC_002679	CGTG	2	8	176922	176929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3604	NC_002679	TCGGC	2	10	176934	176943	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3605	NC_002679	GGGC	2	8	176980	176987	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3606	NC_002679	CGC	2	6	177045	177050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488119
3607	NC_002679	GC	3	6	177049	177054	0 %	0 %	50 %	50 %	13488119
3608	NC_002679	GCG	2	6	177104	177109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488119
3609	NC_002679	CTTC	2	8	177125	177132	0 %	50 %	0 %	50 %	13488119
3610	NC_002679	TCA	3	9	177143	177151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488119
3611	NC_002679	TGA	2	6	177215	177220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488119
3612	NC_002679	TCA	2	6	177263	177268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488119
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3614	NC_002679	CGA	3	9	177386	177394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488119
3615	NC_002679	GCT	2	6	177594	177599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_002679	GACA	2	8	177602	177609	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3617	NC_002679	TAAGA	2	10	177650	177659	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_002679	GAT	2	6	177671	177676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_002679	GCGA	2	8	177709	177716	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3620	NC_002679	TCG	2	6	177728	177733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_002679	GAG	2	6	177801	177806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_002679	GGGGGC	2	12	177809	177820	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
3623	NC_002679	TGC	2	6	177868	177873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3625	NC_002679	GACG	2	8	178117	178124	25 %	0 %	50 %	25 %	13488331
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4000	NC_002679	GGC	2	6	197582	197587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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